中科院團隊建成健康人群腸道微生物菌株資源庫

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中新社北京6月8日電 (記者 孫自法)記者8日從中國科學院微生物研究所(中科院微生物所)獲悉,該所劉雙江研究團隊曆時兩年研究,最新已建成資源豐富的健康人群腸道微生物菌株資源庫(human gut microbe biobank, hGMB),為構建中華腸道微生物資源庫奠定了重要基礎。

劉雙江研究員介紹,hGMB包括400個不同物種,其中102個物種為首次分離、培養和鑒定,1170株代表性菌株保存在中國普通微生物菌種保藏中心,已向科研界和產業界提供數次菌株服務,支持腸道微生物功能開發和微生物-宿主互作的研究。為更加充分發揮和挖掘菌株資源的價值,hGMB物種信息已在官網公布。

構建中華腸道微生物資源庫具有長遠戰略意義和經濟社會價值。hGMB構建過程中,研究團隊從239例來自不同地區、不同年齡的體檢健康人群的新鮮糞便樣品中挑取超過2萬個單克隆菌落,擴大培養後從中鑒定出超過1萬個純培養分離株,並對本次發現的全部新物種進行基因組測序和分類學描述與命名。

研究團隊通過對健康人腸道宏基因組分析,發現菌株資源庫中的85個新物種出現在超過90%健康人腸道中。進一步對全球人腸道相關數據分析表明,hGMB覆蓋79%人腸道已知常見菌屬和75%常見物種;與目前最大的人腸道基因組數據庫(UHGG)比對發現,hGMB貢獻出24個在腸道免培養組學研究中未被探測到卻普遍存在的“暗”物種。

越來越多的證據表明,腸道微生物與宿主健康和生長發育密切相關,在未來人體健康管理和醫療產業發展中,腸道微生物資源潛力巨大,在揭示宿主表型與腸道菌群因果關係的研究中,也發揮至關重要作用。由中科院微生物所劉雙江、劉暢、杜夢璿、熱西丁·阿不都艾尼、於海英等共同完成hGMB構建的重要成果論文,近期已在國際專業學術期刊《微生物組》(Microbiome)發表。

中科院微生物所稱,在成功構建hGMB之前,劉雙江團隊2020年還發表迄今最大的模式動物小鼠腸道微生物資源庫(mGMB),mGMB包含126種微生物及其基因組,其中77種微生物是首次成功分離培養的新物種,使得可培養的小鼠腸道微生物菌株資源從48屬76種增至110屬180種,並在此過程中形成一套厭氧微生物分離培養與物種鑒定描述的最簡標準化流程。(完) 【編輯:田博群】

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